Collections : Histoire,Photographie,Sciences de la nature,Technique et industrie
Thématiques : Sciences de la nature : Botanique, Entomologie, Géologie, Herpétologie, Invertébrés, Ichtyologie, Malacologie, Mammalogie, Minéralogie, Ornithologie, Paléontologie;Sciences et techniques : Sciences médicales
Patrimoine scientifique rassemblé depuis le XVIIIe siècle. Paléontologie locale (93 types et figurés, principalement d'invertébrés). Herbiers : herbier médicinal du XVIIIe siècle de l'Hôtel-Dieu (actuelle Abbaye Saint-Germain), flore de l'Yonne (XIXe siècle). Collection de modèles botaniques en plâtre Vilmorin-Andrieux. Fonds Paul Bert : archives scientifiques, manuscrits, instruments. Importante collection ornithologique
Maison bourgeoise du XIXe siècle, ayant appartenu à une famille industrielle importante dans l'histoire locale (famille Guilliet). Serre du XIXe siècle.