Le terme Merquel est une déformation d'un mot qui signifiat "monastère".
Premier lieu de culte mesquérais au VIè siècle, la chapelle du prieuré de Merquel fut dédiée à Saint Gildas et dépendant de l'abbaye de Saint-Gildas de Rhuys dans le Morbihan. Cependant, dans la rivalité qui opposa les Francs et les Bretons et dans la lutte des évêques de Nantes pour étendre leur juridiction jusqu'à la Vilaine, il n'est pas étonnant que pour contrebalancer l'influence bretonne, on ait implanté, tout près du couvent, un édifice religieux en l'honneur d'un saint français, en l'occurence Saint-Marc de Soissons.